JAXA の中期計畫において、「大學共同利用システムを基本とする宇宙科學研究においては、有識者による評価をその後の事業に十分に反映させる」と定めています。
これを踏まえ、宇宙科學研究所の學術研究とそれに関連する活動について、宇宙理學と宇宙工學の長期的な視野にたって評価することを目的として、5年に一度を目途に、宇宙科學研究所の外部評価委員會を開催し、外部評価を実施しています。

なお、外部評価とは別に、JAXA は、獨立行政法人通則法に基づき、毎年政府による評価も受けています。